二者區別在于：java文件是源程序，class文件是編譯后的代碼。
關于源程序
未經編譯的，按照一定的程序設計語言規范書寫的，人類可讀的文本文件。
源程序可以是以書籍或磁帶或其他載體的形式出現，但最為常用的格式是文本文件，這種典型格式的目的是為了編譯出計算機可執行的程序。
將人類可讀的程序代碼文本翻譯成為計算機可以執行的二進制指令，這種過程叫做編譯，由各種編譯器來完成。一般用高級語言編寫的程序稱為“源程序”。
java文件就是這樣一個未經編譯的源程序，一般是給程序員看的。
編譯程序
編譯程序（Compiler，compiling program）也稱為編譯器，是指把用高級程序設計語言書寫的源程序，翻譯成等價的機器語言格式目標程序的翻譯程序。
編譯程序屬于采用生成性實現途徑實現的翻譯程序。它以高級程序設計語言書寫的源程序作為輸入，而以匯編語言或機器語言表示的目標程序作為輸出。
編譯出的目標程序通常還要經歷運行階段，以便在運行程序的支持下運行，加工初始數據，算出所需的計算結果。
class文件就是被編譯器編譯過的java文件，通常是給計算機看的。
擴展資料：
JAVA工作原理：
使用文字編輯軟件或集成開發環境在Java源文件中定義不同的類 ；
通過調用類中的方法來訪問資源系統；
把源文件編譯生成一種二進制中間碼，存儲在class文件中；
然后再通過運行與操作系統平臺環境相對應的Java虛擬機來運行class文件，執行編譯產生的字節碼，調用class文件中實現的方法來滿足程序的Java API調用。
參考資料：
源程序-百度百科
編譯程序-百度百科
class和struct的區別：
1、class是引用類型，struct是值類型；
2、class可以繼承類、接口和被繼承，struct只能繼承接口，不能被繼承；
3、class有默認的無參構造函數，有析構函數，struct沒有默認的無參構造函數，且只能聲明有參的構造函數，沒有析構函數；
4、class可以使用abstract和sealed，有protected修飾符，struct不可以用abstract和sealed，沒有protected修飾符；
5、class必須使用new初始化，結構可以不用new初始化；
6、class實例由垃圾回收機制來保證內存的回收處理，而struct變量使用完后立即自動解除內存分配；
7、從職能觀點來看，class表現為行為，而struct常用于存儲數據；
8、作為參數傳遞時，class變量以按址方式傳遞，而struct變量是以按值方式傳遞的。
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