男科病的檢查，原則上同其它科疾病的檢查方法相同，最基本的檢查步驟仍是病史的詢問和體格檢查。認真細致的體格檢查，對診斷男科病有著重要的意義。
為了全面了解病情，分析病因，醫生會向患者詳細地詢問病史，才能為診斷提供可靠的線索。
詢問病史的內容有：
（1）一般情況，即職業、嗜好、工作環境等；
（2）既往史：即過去患過何種疾病；
（3）婚姻與性生活史；
（4）家族史：有無遺傳性疾病。
男科病的主要癥狀多表現為疼痛、腫物、性機能改變等方面。在被詢問時就要說清疼痛性質、程度、時間的長短、局部痛還是放射性痛；有腫物時要指出腫物的具體部位；在性機能改變方面，有器質性原因，也有精神因素，因此要把病情介紹清楚。
詢問完病史后，即可進行體格檢查。在體格檢查中，醫生會根據詢問病史所掌握的線索來進行體格檢查。男科病的體格檢查包括全身檢查和對生殖器官的檢查。全身檢查如心、肺、肝、脾、腎有無異常等，尤其不能忽略身高、體重、發育營養狀況、毛發陰毛分布等情況，有無內分泌和遺傳方面的先天異常。檢查方法與一般疾病的體格檢查相同。
生殖器官的檢查在男科病的體格檢查中占有重要位置。檢查內容包括對陰莖、尿道、睪丸、附睪、精索、前列腺器官的檢查。男性生殖器官的檢查是以望診和觸診為主。望診是醫生用視覺來觀察病人全身或局部表現。可借助其它手段查看陰莖是否為嚴重包莖，陰莖的大小，有無硬結、炎癥、腫瘤、發育異常等；陰囊有無水腫；尿道有無排尿困難、瘺孔、下裂、硬結及狹窄、尿道口有無分泌物。
除了以上的可通過望診檢查外，有些則需要用觸診的方法來檢查。觸診是醫生通過手的感覺進行診斷的一種方法。如對前列腺的檢查，可通過肛門指診，檢查它的大小、有無肥大、硬結、腫物等，還可通過按摩前列腺采集前列腺液送實驗室檢查。睪丸檢查包括睪丸的大小、硬度、有無硬結、壓痛、鞘膜積液、腫物，是否為隱睪。精索的檢查包括輸精管的硬度，有無硬結、壓痛以及有無精索靜脈曲張等。
談到體格檢查時，應該按照一定的順序進行。這樣才能檢查的全面、系統、詳盡、避免遺漏。一般先從望診開始，然后再輔以觸診。醫生在做生殖系統的檢查時，會做到體貼入微、動作輕柔。有些檢查醫生會向患者說明檢查目的。作為患者，應該積極配合，這樣才能做好體格檢查。
